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Die folgenden Abschnitte beschreiben die Besonderheiten, die ein Benutzer der Java native Schnittstellen (JNI) im BS2000 zu beachten hat. Auf die allgemeine (also betriebssystemunabhängige) Benutzung der native Schnittstellen wird hier nicht tiefgehend eingegangen.
Dafür stehen Spezifikationen und Tutorials im Internet und auf dem Buchmarkt zur Verfügung.
Die Verwendung des JNI für reale Anwendungen ist nicht einfach, weil komplexe Wechselwirkungen zwischen der Java- und der C-Umgebung möglich sind. Vor einer Entscheidung für die Nutzung des JNI sollten Alternativen sorgfältig diskutiert werden.