openFT kann auf Anforderung des Nutzers Daten verschlüsselt versenden (siehe auch Abschnitt „Verschlüsselung der Dateiinhalte").
Bei Dateimanagementaufträgen kann der Benutzer verlangen, dass die Attribute von Dateien und Verzeichnissen verschlüsselt übertragen werden sollen, siehe auch Abschnitt „Verschlüsselung bei Dateimanagementaufträgen".
Die Option Verschlüsselung ist aus rechtlichen Gründen nicht in allen Ländern verfügbar, d.h. die verschlüsselte Dateiübertragung oder verschlüsseltes Dateimanagement mit ausländischen Partnern ist nicht in jedem Fall gewährleistet.
Von openFT verschlüsselte Daten können über das FTP-Protokoll nur Outbound und nur mit Secure-FTP-Partnern ausgetauscht werden. Mit FTAM-Partnern können keine per openFT verschlüsselten Daten ausgetauscht werden.
Verschlüsselte Dateiübertragung und verschlüsseltes Dateimanagement setzen voraus, dass auf openFT-Seite immer openFT-CR installiert sein muss, d.h. auch im Partnersystem, wenn dort ein openFT läuft.